Keizer Karel IV is gekroond tot koning van Bohemen en keizer van het Heilige Roomse Rijk. Vanuit zijn kasteel in Praag overziet hij de constructie van nieuwe versterkingen: een brug over de Vltava River, een universiteit en een kathedraal binnen de stadsmuren. Praag is al één van de grootste steden in Europa op dat moment, maar Keizer Karel IV wil er de hoofdstad van zijn keizerrijk van maken.
In Praga Caput Regni nemen spelers de rol van welvarende burgers die de verschillende bouwprojecten in Praag organiseren. Door hun rijkdom te vergroten en mee te doen aan de constructie komen ze in de gratie van de koning. De spelers kiezen tussen zes acties die altijd beschikbaar zijn, maar constant verschillende kosten en voordelen hebben. Met deze acties verzamel je grondstoffen, vergroot je de kracht van je acties en bouw je mee aan “Nieuw Praag”, de Karel-brug of de stadsmuren.
Aan het einde van het spel wint de speler die de koning het meest onder de indruk heeft gebracht!